駒込高校には、17の運動部(同好会含)と13の文化部、合計30の部活動があります。
運動部 文化部
・柔道
・卓球
・硬式野球
・アメフト
・サッカー
・登山スキー
・男子バレー
・男子硬式テニス
・男子バスケットボール
・剣道
・陸上
・ハンドボール
・ラグビー
・バドミントン
・ダンス同好会
・女子バレー
・女子硬式テニス
・女子バスケットボール
・書道
・演劇
・美術
・和太鼓
・漫画研究会
・ボランティア
・パソコン
・合唱
・茶道
・華道
・吹奏楽
・仏教研究
・自然科学